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目的 对1株分离自牛狂犬病疫区野鼠脑内的狂犬病毒野毒株(MRV)进行全基因组测序,并对其分子变异和进化特点进行分析.方法 RT-PCR扩增克隆覆盖全基因组9个重叠基因片段.基因组3'末端和5'末端采取3'-RACE和5'-RACE方法.结果 9个重叠基因片段序列拼接得到MRV全基因组序列,共11 869个核苷暖.MRV毒株全基因组构成与其他狂犬病毒基因组构成相似,由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,在核蛋白和糖蛋白的重要抗原位点有个别氨基酸发生变异.选择有代表性的狂犬病毒株,构建了N基因分子系统进化树.结论 MRV毒株属于狂犬病毒基因1型,与AV01和CVS同源性最高为99

作者:赵云蛟;郭荆;黄莹;张立世;钱爱东

来源:中国人兽共患病学报 2008 年 24卷 7期

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作者:
赵云蛟;郭荆;黄莹;张立世;钱爱东
来源:
中国人兽共患病学报 2008 年 24卷 7期
标签:
狂犬病毒 全基因组 序列分析
目的 对1株分离自牛狂犬病疫区野鼠脑内的狂犬病毒野毒株(MRV)进行全基因组测序,并对其分子变异和进化特点进行分析.方法 RT-PCR扩增克隆覆盖全基因组9个重叠基因片段.基因组3'末端和5'末端采取3'-RACE和5'-RACE方法.结果 9个重叠基因片段序列拼接得到MRV全基因组序列,共11 869个核苷暖.MRV毒株全基因组构成与其他狂犬病毒基因组构成相似,由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,在核蛋白和糖蛋白的重要抗原位点有个别氨基酸发生变异.选择有代表性的狂犬病毒株,构建了N基因分子系统进化树.结论 MRV毒株属于狂犬病毒基因1型,与AV01和CVS同源性最高为99