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目的:分析中国汉族人群信号传导和转录活化因子-4(STAT4)基因的单核苷酸多态性(SNPs),探讨其与RA易感性之间的关系。方法利用HapMap中国汉族人(CHB)数据,选择STAT4基因的标签SNPs(r2=0.9)。在228例RA患者和228名健康对照中,用多重PCR(iPLEX)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS),对STAT4基因的23个SNPs位点进行基因分型。使用χ2和Fisher确切概率法检验分析是否符合Hardy-Weinberg平衡,各基因型及等位基因频率比较采用χ2检验,所用软件为Haploview 4.1软件。结果所检测的STAT4的多态性位点中,有3个SNPs位点rs11685878、rs12988825和rs16833437的等位基因频率在2组间的差异有统计学意义(χ2=6.0148,4.0248,5.5391,P<0.05)。有3个位点rs11685878、rs16833437和rs12988825的基因型频率在2组间的差异有统计学意义(χ2=6.8149,6.0987,6.6917,P<0.05)。结论 STAT4基因的多个SNPs位点的等位基因频率或基因型频率与中国汉族RA之间存在相关性。

作者:魏萌;谢庆云;王涛;程悦;张凡;郭东阳;朱军

来源:中华风湿病学杂志 2016 年 2期

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作者:
魏萌;谢庆云;王涛;程悦;张凡;郭东阳;朱军
来源:
中华风湿病学杂志 2016 年 2期
标签:
关节炎,类风湿 多态性,单核苷酸 信号传导和转录活化因子 关联分析 Arthritis,rheumatoid Polymorphism,single nucleotide Signal transducer and activator of transcription Association
目的:分析中国汉族人群信号传导和转录活化因子-4(STAT4)基因的单核苷酸多态性(SNPs),探讨其与RA易感性之间的关系。方法利用HapMap中国汉族人(CHB)数据,选择STAT4基因的标签SNPs(r2=0.9)。在228例RA患者和228名健康对照中,用多重PCR(iPLEX)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS),对STAT4基因的23个SNPs位点进行基因分型。使用χ2和Fisher确切概率法检验分析是否符合Hardy-Weinberg平衡,各基因型及等位基因频率比较采用χ2检验,所用软件为Haploview 4.1软件。结果所检测的STAT4的多态性位点中,有3个SNPs位点rs11685878、rs12988825和rs16833437的等位基因频率在2组间的差异有统计学意义(χ2=6.0148,4.0248,5.5391,P<0.05)。有3个位点rs11685878、rs16833437和rs12988825的基因型频率在2组间的差异有统计学意义(χ2=6.8149,6.0987,6.6917,P<0.05)。结论 STAT4基因的多个SNPs位点的等位基因频率或基因型频率与中国汉族RA之间存在相关性。