目的:基于生物信息学分析建立肝内胆管细胞癌(ICC)患者的铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)预后模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取36例ICC和9例正常人群基因表达数据及相应临床信息,提取与预后相关的铁死亡lncRNA并构建预后模型。通过Cox回归模型和ROC曲线验证铁死亡相关lncRNA预后模型的预测能力。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果:多因素Cox回归分析筛选出AL161431.1和LINC01587两个铁死亡相关lncRNA为ICC生存预后的独立预测因子(HR=2.99,7.23;P<0.05)。建立ICC患者lncRNA预后模型,风险评分=1.096×AL161431.1+1.979×LINC01587。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组与低风险组的总体生存期差异有统计学意义(χ2=6.54,P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,铁死亡相关lncRNA风险评分是一个独立的预后指标(HR=1.12,P<0.05)。该模型1、2、3年生存的时间依赖性ROC曲线下面积(AUC)分别为0.883,0.837和0.853;而肿瘤分级、分期的1年生存的时间依赖性ROC曲线AUC分别为0.598、0.637,该模型生存预后预测能力明显优于肿瘤分级和分期。结论:本研究构建的铁死亡相关lncRNA预测模型能有效预测ICC患者的生存。
作者:莫建涛;杨沛泽;曹瑞奇;马清涌;王铮;仵正;周灿灿
来源:中华肝脏外科手术学电子杂志 2023 年 12卷 2期