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目的:探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法:选取56 418例精神分裂症患者与78 818名健康对照者的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据和大脑表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTLs),采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based mendelian randomization analysis,SMR)整合分析精神分裂症的重要风险致病基因,并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞(human induced pluripotent stem cell,hiPSC)和全血表达数据集进行差异表达分析,以验证风险基因表达失调情况。结果:基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因( PSMR<5×10 -6),分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示,SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元( Padjust=5.22×10 -3)和hiPSC( Padjust=1.41×10 -4)中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC( Padjust=1.28×10 -8)和全血( Padjust=1.17×10 -4)中表达水平均显著上

作者:贾婷婷;张程程

来源:中华精神科杂志 2022 年 55卷 5期

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作者:
贾婷婷;张程程
来源:
中华精神科杂志 2022 年 55卷 5期
标签:
精神分裂症 数量性状基因座位 全基因组关联研究 易感基因 Schizophrenia Quantitative trait loci Genome-wide association study Risk gene
目的:探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法:选取56 418例精神分裂症患者与78 818名健康对照者的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据和大脑表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTLs),采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based mendelian randomization analysis,SMR)整合分析精神分裂症的重要风险致病基因,并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞(human induced pluripotent stem cell,hiPSC)和全血表达数据集进行差异表达分析,以验证风险基因表达失调情况。结果:基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因( PSMR<5×10 -6),分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示,SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元( Padjust=5.22×10 -3)和hiPSC( Padjust=1.41×10 -4)中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC( Padjust=1.28×10 -8)和全血( Padjust=1.17×10 -4)中表达水平均显著上