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目的 基于结直肠癌全基因组关联研究(GWAS)发现的易感位点,联合传统风险因素建立中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型.方法 对1 066例结直肠癌患者和3 880例健康对照的21个GWAS候选位点进行基因分型,分析其与结直肠癌易感性之间的关联.通过遗传风险评分(GRS)和加权遗传风险评分(wGRS)计算显著候选位点的联合效应.以不同方式组合遗传风险评分和传统风险因素,构建结直肠癌风险预测模型,并绘制受试者工作特征曲线评价模型优劣性.结果 7个候选位点与结直肠癌易感性显著相关.随着风险评分的升高,人群患结直肠癌的风险也随之升高(GRS:P=0.002 6,wGRS:P<0.000 1),相比于四分位分组中最低一组,GRS和wGRS最高的一组OR值分别为1.33 (95%CI:1.12~1.58,P=0.001 0)和1.76 (95% CI:1.45 ~ 2.14,P<0.000 1).联合传统风险因素和wGRS的模型为最优模型,其曲线下面积为0.593(95%CI:0.573~ 0.613).结论 结直肠癌易感位点间存在显著的联合作用.相比于传统风险因素模型,传统风险因素结合加权遗传风险评分模型能更好预测结直肠癌的患病风险.

作者:李娇元;常江;朱颖;杨洋;龚雅洁;柯俊涛;娄娇;钟荣;龚静

来源:中华流行病学杂志 2015 年 36卷 10期

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作者:
李娇元;常江;朱颖;杨洋;龚雅洁;柯俊涛;娄娇;钟荣;龚静
来源:
中华流行病学杂志 2015 年 36卷 10期
标签:
结直肠癌 单核苷酸多态性 风险预测 Colorectal cancer Single-nucleotide polymorphism Risk prediction
目的 基于结直肠癌全基因组关联研究(GWAS)发现的易感位点,联合传统风险因素建立中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型.方法 对1 066例结直肠癌患者和3 880例健康对照的21个GWAS候选位点进行基因分型,分析其与结直肠癌易感性之间的关联.通过遗传风险评分(GRS)和加权遗传风险评分(wGRS)计算显著候选位点的联合效应.以不同方式组合遗传风险评分和传统风险因素,构建结直肠癌风险预测模型,并绘制受试者工作特征曲线评价模型优劣性.结果 7个候选位点与结直肠癌易感性显著相关.随着风险评分的升高,人群患结直肠癌的风险也随之升高(GRS:P=0.002 6,wGRS:P<0.000 1),相比于四分位分组中最低一组,GRS和wGRS最高的一组OR值分别为1.33 (95%CI:1.12~1.58,P=0.001 0)和1.76 (95% CI:1.45 ~ 2.14,P<0.000 1).联合传统风险因素和wGRS的模型为最优模型,其曲线下面积为0.593(95%CI:0.573~ 0.613).结论 结直肠癌易感位点间存在显著的联合作用.相比于传统风险因素模型,传统风险因素结合加权遗传风险评分模型能更好预测结直肠癌的患病风险.