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目的:探讨人肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)相互作用蛋白1(TNIP1)基因多态性与汉族人系统性红斑狼疮(SLE)的遗传关联性。方法收集284例汉族人 SLE 和630例汉族人对照,选择 TNIP1基因区域120个单核苷酸多态性(SNP),利用连接酶检测反应(LDR)对其进行基因分型,对分型数据利用 PLINK 1.07和 Haploview 软件进行统计分析。结果经过数据质控,最终105个 SNP 的分型数据进入最终统计分析。rs3805433 C、rs12516176 C、rs6869605 C 和 rs4958882 G 的等位基因频率在 SLE 组(参考等位基因频率0.301~0.306)高于对照组(参考等位基因频率0.221~0.225),差异有统计学意义(OR:1.50~1.53,均 P <4.72×10-4)。这4个SNP 间存在强连锁不平衡(r2≥0.871,D′≥0.938),且与既往报道的 SLE 相关 SNP rs10036748间存在中等程度的连锁不平衡(r2≥0.073,D′≥0.868)。单倍型分析发现,单倍型(H2:CCCGT)在病例组中的频率(0.290)显著高于对照组(0.210),差异有统计学意义(OR =1.54,P <4.72×10-4)。结论 TNIP1基因多态性与汉族人 SLE具有相关性。

作者:王勇;韩建文;李鸿斌;阿拉腾楚鲁;孙志强;吕新翔;乌日娜

来源:中华皮肤科杂志 2016 年 3期

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作者:
王勇;韩建文;李鸿斌;阿拉腾楚鲁;孙志强;吕新翔;乌日娜
来源:
中华皮肤科杂志 2016 年 3期
标签:
红斑狼疮,系统性 多态性,单核苷酸 遗传关联研究 基因,TNIP1 Lupus erythematosus,systemic Polymorphism,single nucleotide Genetic association studies Genes,TNIP1
目的:探讨人肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)相互作用蛋白1(TNIP1)基因多态性与汉族人系统性红斑狼疮(SLE)的遗传关联性。方法收集284例汉族人 SLE 和630例汉族人对照,选择 TNIP1基因区域120个单核苷酸多态性(SNP),利用连接酶检测反应(LDR)对其进行基因分型,对分型数据利用 PLINK 1.07和 Haploview 软件进行统计分析。结果经过数据质控,最终105个 SNP 的分型数据进入最终统计分析。rs3805433 C、rs12516176 C、rs6869605 C 和 rs4958882 G 的等位基因频率在 SLE 组(参考等位基因频率0.301~0.306)高于对照组(参考等位基因频率0.221~0.225),差异有统计学意义(OR:1.50~1.53,均 P <4.72×10-4)。这4个SNP 间存在强连锁不平衡(r2≥0.871,D′≥0.938),且与既往报道的 SLE 相关 SNP rs10036748间存在中等程度的连锁不平衡(r2≥0.073,D′≥0.868)。单倍型分析发现,单倍型(H2:CCCGT)在病例组中的频率(0.290)显著高于对照组(0.210),差异有统计学意义(OR =1.54,P <4.72×10-4)。结论 TNIP1基因多态性与汉族人 SLE具有相关性。