目的 筛选并分析白纹伊蚊感染登革病毒后病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs.方法 白纹伊蚊羽化后2~4d雌性成蚊显微注射DENV-2病毒NGC株,对照组注射生理盐水.8d后提取样品总RNA,分离小RNA,通过illumina Hiseq 2000测序仪进行测序分析.以SOAP2软件与DENV-2基因组和互补序列进行比对.对病毒特异性的vsRNAs与vpiRNAs的长度、碱基与链偏好性、基因组分布进行分析.结果 对于感染蚊虫,我们共计获得3835个特异的DENV-2来源的vsRNAs,其中395个特异性的vpiRNAs.94.99% vpiRNAs主要来源于病毒的正链基因组.vpiRNAs在DENV-2基因组上的分布也具有偏向性,最高峰位于病毒非结构蛋白NS5编码区域的3'末端.第10位碱基具有较强的腺嘌呤偏好性,但第1位碱基不具有尿嘧啶偏好性;也无典型“乒乓”扩增循环的特征.结论 白纹伊蚊感染登革病毒后,体内出现病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs,对其鉴定与分析将为在白纹伊蚊抗病毒免疫研究提供理论基础.
作者:赖植发;王衍海;顾金保;陈晓光
来源:中华实验和临床病毒学杂志 2014 年 28卷 4期