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目的 了解四川省广元市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况,明确病原基因型别,并对其基因特征进行初步研究.方法 采集广元市2017年2月至5月4起AGE疫情病例的粪便标本18份、肛拭子标本15份,采用实时荧光RT-PCR检测NoV基因,NoV阳性标本用传统RT-PCR扩增并进一步测序分型.结果 NoV实时荧光RT-PCR结果显示4起疫情均为NoV感染引起的暴发,检测阳性率为60.6%(20/31).基因序列比对和进化分析结果显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV,且核苷酸高度同源,其中1起除GⅡ.P16/GⅡ.2型外还检出GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV.结论 四川省广元市4起AGE暴发疫情主要由GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV引起,同时存在GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV混合感染.

作者:侯雪芹;任敏;熊丽;朱俊;曹冉冉;马小珍

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2019 年 33卷 1期

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作者:
侯雪芹;任敏;熊丽;朱俊;曹冉冉;马小珍
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2019 年 33卷 1期
标签:
诺如病毒 胃肠炎 暴发 系统进化分析 Norovirus Gastroenteritis Outbreak Phylogenetic analysis
目的 了解四川省广元市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况,明确病原基因型别,并对其基因特征进行初步研究.方法 采集广元市2017年2月至5月4起AGE疫情病例的粪便标本18份、肛拭子标本15份,采用实时荧光RT-PCR检测NoV基因,NoV阳性标本用传统RT-PCR扩增并进一步测序分型.结果 NoV实时荧光RT-PCR结果显示4起疫情均为NoV感染引起的暴发,检测阳性率为60.6%(20/31).基因序列比对和进化分析结果显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV,且核苷酸高度同源,其中1起除GⅡ.P16/GⅡ.2型外还检出GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV.结论 四川省广元市4起AGE暴发疫情主要由GⅡ.P16/GⅡ.2型NoV引起,同时存在GⅡ.P7/GⅡ.14型NoV混合感染.