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目的:探讨新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)患儿微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达情况及其意义。方法收集2014年10月至2015年11月在广州市妇女儿童医疗中心确诊为Bell分期Ⅱ期及Ⅱ期以上的NEC患儿25例,同期非NEC新生儿25例作为对照组。取外周血提取白细胞。随机选取对照组与NEC组各5例的标本,用Illumina二代高通量测序技术进行测序,筛选出有差异的miRNA,并进行靶基因预测及生物学功能分析。其余标本采用实时荧光定量-聚合酶链反应技术检测差异表达的miRNA的相对表达量,验证上述高通量测序的结果。应用DEGseq软件对2组数据的miRNA进行差异表达分析统计。P<0.05为差异有统计学意义。以P<0.01,q<0.001,丨Log2 Ratio丨≥1作为差异表达的筛选标准。采用MeV4.6软件对NEC组与对照组差异表达的miRNA进行聚类分析。结果 NEC组与对照组有482个miRNA表达差异有统计学意义(P<0.05),其中126个为已知显著差异表达的miRNA,其中上调58个,下调68个。表达上调的 hsa-miR-223-5p、hsa-miR-183-3p 和 hsa-miR-222-5p,以及下调的 hsa-miR-23b-5p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-146a-3p 和 hsa-miR-1298-5p的验证结果与测序结果相符。生物信息学分析发现,在NEC患儿中有显著差异的

作者:杨丽;周伟;尧杰;袁伟明;荣箫;李雁彬;唐娟

来源:中华围产医学杂志 2017 年 20卷 1期

知识库介绍

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作者:
杨丽;周伟;尧杰;袁伟明;荣箫;李雁彬;唐娟
来源:
中华围产医学杂志 2017 年 20卷 1期
标签:
小肠结肠炎,坏死性 微RNAs 高通量核苷酸序列分析 婴儿,新生 Enterocolitis,necrotizing MicroRNAs High-throughput nucleotide sequencing Infant,newborn
目的:探讨新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)患儿微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达情况及其意义。方法收集2014年10月至2015年11月在广州市妇女儿童医疗中心确诊为Bell分期Ⅱ期及Ⅱ期以上的NEC患儿25例,同期非NEC新生儿25例作为对照组。取外周血提取白细胞。随机选取对照组与NEC组各5例的标本,用Illumina二代高通量测序技术进行测序,筛选出有差异的miRNA,并进行靶基因预测及生物学功能分析。其余标本采用实时荧光定量-聚合酶链反应技术检测差异表达的miRNA的相对表达量,验证上述高通量测序的结果。应用DEGseq软件对2组数据的miRNA进行差异表达分析统计。P<0.05为差异有统计学意义。以P<0.01,q<0.001,丨Log2 Ratio丨≥1作为差异表达的筛选标准。采用MeV4.6软件对NEC组与对照组差异表达的miRNA进行聚类分析。结果 NEC组与对照组有482个miRNA表达差异有统计学意义(P<0.05),其中126个为已知显著差异表达的miRNA,其中上调58个,下调68个。表达上调的 hsa-miR-223-5p、hsa-miR-183-3p 和 hsa-miR-222-5p,以及下调的 hsa-miR-23b-5p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-146a-3p 和 hsa-miR-1298-5p的验证结果与测序结果相符。生物信息学分析发现,在NEC患儿中有显著差异的