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目的 探讨Toll样受体通路相关基因的遗传变异与胃癌及食管鳞状细胞癌易感性之间的关系.方法 运用adaptive rank-truncated product (ARTP)方法,从通路及基因水平分析中国胃癌及食管鳞状细胞癌高发人群的全基因组关联研究数据,运用非条件Logistic回归分析的additive模型分析通路相关单核苷酸多态性(SNP)与胃癌及食管鳞状细胞癌的关系.运用PLINK 1.07及SPSS 19.0软件进行一般的统计学分析,运用R3.0.2软件中“ARTP”程序包进行基因及通路水平分析.结果 在基因水平的分析中,发现8个基因与胃癌易感性相关(P<0.05),6个基因与食管鳞状细胞癌相关(P<0.05).在单个SNP水平的分析中,21个SNP与胃癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01),11个SNP与食管鳞状细胞癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01).结论 某些TLR通路相关基因的遗传变异与胃癌或食管鳞状细胞癌患病危险性之间存在一定关联,需进一步研究其潜在分子机制.

作者:谭娟;王震华;余晨阳;陈豪燕;关建;陈萦晅;房静远

来源:中华消化杂志 2015 年 35卷 3期

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作者:
谭娟;王震华;余晨阳;陈豪燕;关建;陈萦晅;房静远
来源:
中华消化杂志 2015 年 35卷 3期
标签:
胃肿瘤 食管肿瘤 癌,鳞状细胞 变异(遗传学) 全基因组关联研究 多态性 单核苷 Toll样受体通路 Stomach neoplasms Esophageal neoplasms Carcinoma,squamous cell Variation (genetics) GWAS Single nucleotide polymorphisms Toll-like receptor pathway
目的 探讨Toll样受体通路相关基因的遗传变异与胃癌及食管鳞状细胞癌易感性之间的关系.方法 运用adaptive rank-truncated product (ARTP)方法,从通路及基因水平分析中国胃癌及食管鳞状细胞癌高发人群的全基因组关联研究数据,运用非条件Logistic回归分析的additive模型分析通路相关单核苷酸多态性(SNP)与胃癌及食管鳞状细胞癌的关系.运用PLINK 1.07及SPSS 19.0软件进行一般的统计学分析,运用R3.0.2软件中“ARTP”程序包进行基因及通路水平分析.结果 在基因水平的分析中,发现8个基因与胃癌易感性相关(P<0.05),6个基因与食管鳞状细胞癌相关(P<0.05).在单个SNP水平的分析中,21个SNP与胃癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01),11个SNP与食管鳞状细胞癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01).结论 某些TLR通路相关基因的遗传变异与胃癌或食管鳞状细胞癌患病危险性之间存在一定关联,需进一步研究其潜在分子机制.