广东省2株白喉棒状杆菌的鉴定与分析-临床诊疗知识库

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作者：

李振翠；刘美真；方艳梅；贡梓军；王旭麟；陈经雕；李柏生

来源：

中华预防医学杂志 2022 年 56卷 4期

标签：

白喉棒状杆菌全基因组测序 wgSNP进化树鉴定 Corynebacterium diphtheriae Whole genome sequencing wgSNP phylogenetic tree Identification

目的:对广东省2株 C. diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。方法:通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的 C. diphtheriae进行生化及质谱鉴定；利用Illumina平台进行测序，CLC软件拼接，JSpeciesWS线上工具进行平均核苷酸同源性识别；BLASTN进行 narKGHIJ和 tox基因检测，使用MEGA-X构建wgSNP系统发育进化树。结果:GD-Guangzhou-2010为Belfanti型，GD-Zhuhai-2020为Gravis型。棒状杆菌种间ANI值计算结果显示，GD-Guangzhou-2010与 C.belfantii间ANIb=99.61

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