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目的 探讨可诱导共刺激分子(ICOS)和CD28基因多态性与肺结核易感性的相关性.方法 采用病例-对照研究方法,采集2015年3月至2016年9月江苏省常州市金坛区人民医院就诊的100例肺结核患者(肺结核组)和100名社区健康体检者(健康对照组)的外周静脉血.采用高通量测序方法,对56个ICOS和CD28基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因分型以及连锁不平衡分析和遗传模块分析,探讨两组SNP基因型和等位基因频率的差异.结果 共23个SNP被剔除[哈温平衡卡方检验P值(HWE-P) <0.001或者最小等位基因频率<0.05].肺结核组ICOS基因SNP位点(rs55663036)的T等位基因频率、TT基因型和CD28基因位点(rs45620941)的GG基因型的频率显著高于健康对照组(均P<0.05).CD28基因rs45620941与rs56262258位点具有较强的连锁不平衡关系(r2=0.757).结论 ICOS基因rs55663036位点和CD28基因rs45620941位点的多态性与肺结核发病风险显著关联.

作者:张兴;吉俊敏;李琼;华天齐;姚萍;蒋靖怡;李书书;王凤鸣

来源:中华医学杂志 2019 年 99卷 44期

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作者:
张兴;吉俊敏;李琼;华天齐;姚萍;蒋靖怡;李书书;王凤鸣
来源:
中华医学杂志 2019 年 99卷 44期
标签:
结核,肺 多态性,单核苷酸 可诱导共刺激分子 CD28 Tuberculosis,pulmonary Polymorphism,single nucleotide Inducible co-stimulator CD28
目的 探讨可诱导共刺激分子(ICOS)和CD28基因多态性与肺结核易感性的相关性.方法 采用病例-对照研究方法,采集2015年3月至2016年9月江苏省常州市金坛区人民医院就诊的100例肺结核患者(肺结核组)和100名社区健康体检者(健康对照组)的外周静脉血.采用高通量测序方法,对56个ICOS和CD28基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因分型以及连锁不平衡分析和遗传模块分析,探讨两组SNP基因型和等位基因频率的差异.结果 共23个SNP被剔除[哈温平衡卡方检验P值(HWE-P) <0.001或者最小等位基因频率<0.05].肺结核组ICOS基因SNP位点(rs55663036)的T等位基因频率、TT基因型和CD28基因位点(rs45620941)的GG基因型的频率显著高于健康对照组(均P<0.05).CD28基因rs45620941与rs56262258位点具有较强的连锁不平衡关系(r2=0.757).结论 ICOS基因rs55663036位点和CD28基因rs45620941位点的多态性与肺结核发病风险显著关联.