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目的 探究在肺腺癌顺铂耐药过程中起关键调控作用的相关基因.方法 利用生物信息学方法在TCGA数据库和GDSC数据库下载肺腺癌患者顺铂敏感组与耐药组之间的差异表达基因,对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,构建蛋白质互作网络,并进行层次聚类分析,筛选得到关键基因并利用实时荧光定量PCR和ELISA法在细胞水平进行验证.通过siRNA沉默A549/DDP细胞中CXCL10基因的表达并检测其对顺铂的敏感度.结果 筛选得到178个差异表达基因,经过聚类分析最终获得肺腺癌顺铂耐药的关键基因CXCL9、CXCL10、NKX2-1以及SFTPA1.暂时选择CXCL10进行后续验证及功能实验.实时荧光定量PCR结果显示CXCL10在A549/DDP细胞中的mRNA表达量显著高于A549细胞(P<0.001),A549/DDP细胞上清液中CXCL10蛋白的表达量高于A549细胞,均与生物信息学预测一致.MTT结果显示沉默CXCL10表达后,A549/DDP细胞对DDP的敏感度增加.结论 CXCL10是调控肺腺癌顺铂耐药的关键基因,下调CXCL10表达可成为逆转肺腺癌顺铂耐药的潜在靶点.

作者:王霖;黄紫弦;尤程程;谭顺梓;黄利鸣;黄益玲

来源:肿瘤防治研究 2022 年 49卷 6期

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作者:
王霖;黄紫弦;尤程程;谭顺梓;黄利鸣;黄益玲
来源:
肿瘤防治研究 2022 年 49卷 6期
标签:
肺腺癌 生物信息学 差异表达基因 顺铂耐药
目的 探究在肺腺癌顺铂耐药过程中起关键调控作用的相关基因.方法 利用生物信息学方法在TCGA数据库和GDSC数据库下载肺腺癌患者顺铂敏感组与耐药组之间的差异表达基因,对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,构建蛋白质互作网络,并进行层次聚类分析,筛选得到关键基因并利用实时荧光定量PCR和ELISA法在细胞水平进行验证.通过siRNA沉默A549/DDP细胞中CXCL10基因的表达并检测其对顺铂的敏感度.结果 筛选得到178个差异表达基因,经过聚类分析最终获得肺腺癌顺铂耐药的关键基因CXCL9、CXCL10、NKX2-1以及SFTPA1.暂时选择CXCL10进行后续验证及功能实验.实时荧光定量PCR结果显示CXCL10在A549/DDP细胞中的mRNA表达量显著高于A549细胞(P<0.001),A549/DDP细胞上清液中CXCL10蛋白的表达量高于A549细胞,均与生物信息学预测一致.MTT结果显示沉默CXCL10表达后,A549/DDP细胞对DDP的敏感度增加.结论 CXCL10是调控肺腺癌顺铂耐药的关键基因,下调CXCL10表达可成为逆转肺腺癌顺铂耐药的潜在靶点.