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目的:利用网络药理学的方法,探讨天冬活性成分抗肿瘤潜在的作用机制.方法:首先通过查阅相关文献(CNKI、PubMed)及结合TCMID、TCMSP、PubChem等数据库,以药效活性及ADME参数为指标,筛选天冬的活性成分,其次通过BATMAN-TCM数据库、中药靶标数据库、HIT和TTD数据库,筛选天冬活性成分抗肿瘤的潜在作用靶点,建立靶点数据集;利用OMIM数据库筛选抗肿瘤相关的靶标;利用PPI数据库构建天冬和抗肿瘤作用的交互靶标;并用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-疾病”复杂网络关系图和利用ClueGO捅件进行GO(基因功能)分.析,通过STRING数据库、生物学信息注释数据库(DAVID)和KEGG Pathway数据库等进行蛋白相互作关系分析、靶点基因功能富集分析和信号通路分析.结果:筛选得到天冬10个活性成分,通过Degree、Betweenness Centrality、Closeness Centrality等网络拓扑特征评价筛选出12个靶标在抗肿瘤过程中起重要的作用,并利用KEGG数据库对12个靶标进行相关通路富集分析,筛选出31条通路参与抗肿瘤作用.网络分析结果表明天冬抗肿瘤的作用机制可能与调节趋化因子、Hepatitis B、癌症、肿瘤坏死因子、MAPK、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/AKT(蛋白激酶B)等信号通路中的转录失调等过程有关,同时也与参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎

作者:黄旭龙;郝俊杰;徐锋;王祥培;吴红梅

来源:中药材 2019 年 42卷 9期

知识库介绍

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作者:
黄旭龙;郝俊杰;徐锋;王祥培;吴红梅
来源:
中药材 2019 年 42卷 9期
标签:
天冬 活性成分 抗肿瘤 网络药理学 作用机制
目的:利用网络药理学的方法,探讨天冬活性成分抗肿瘤潜在的作用机制.方法:首先通过查阅相关文献(CNKI、PubMed)及结合TCMID、TCMSP、PubChem等数据库,以药效活性及ADME参数为指标,筛选天冬的活性成分,其次通过BATMAN-TCM数据库、中药靶标数据库、HIT和TTD数据库,筛选天冬活性成分抗肿瘤的潜在作用靶点,建立靶点数据集;利用OMIM数据库筛选抗肿瘤相关的靶标;利用PPI数据库构建天冬和抗肿瘤作用的交互靶标;并用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-疾病”复杂网络关系图和利用ClueGO捅件进行GO(基因功能)分.析,通过STRING数据库、生物学信息注释数据库(DAVID)和KEGG Pathway数据库等进行蛋白相互作关系分析、靶点基因功能富集分析和信号通路分析.结果:筛选得到天冬10个活性成分,通过Degree、Betweenness Centrality、Closeness Centrality等网络拓扑特征评价筛选出12个靶标在抗肿瘤过程中起重要的作用,并利用KEGG数据库对12个靶标进行相关通路富集分析,筛选出31条通路参与抗肿瘤作用.网络分析结果表明天冬抗肿瘤的作用机制可能与调节趋化因子、Hepatitis B、癌症、肿瘤坏死因子、MAPK、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/AKT(蛋白激酶B)等信号通路中的转录失调等过程有关,同时也与参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎