目的 筛选前列腺癌发生发展过程中的差异表达基因,构建差异调控网络.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载编号为GSE3325的基因芯片(13例正常、原发性前列腺癌和转移性前列腺癌的独立样本与6例三者的混合样本),筛选前列腺癌和正常前列腺组织的差异基因(P<0.05及差异值>2或<-2);计算差异基因与靶基因间的皮尔森相关系数(| PCC |>0.75),构建差异调控网络;基因本体论(GO)富集方法分析差异调控网络基因的功能.结果 原发性前列腺癌与正常前列腺组织筛选到5847个差异表达基因,转移性前列腺癌与正常前列腺组织筛选到2026个差异基因,原发性前列腺癌与转移性前列腺癌筛选到977个共同的差异基因;原癌基因同源体( MYC)、E2F转录因子1(E2F1)、肿瘤蛋白53( TP53)和雌激素受体1(ESR1)基因在差异调控网络中起核心作用.结论 筛选出前列腺癌的差异表达基因.
作者:王建明;史本康;杨典东;张鹏
来源:中华实验外科杂志 2012 年 29卷 9期