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目的:识别先天性心脏病(CHD)相关GATA5基因新突变. 方法:收集100例无血缘关系的CHD患者和200名无血缘关系且种族匹配的健康对照者的临床资料和血标本.抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增GATA5基因的编码外显子及其剪接位点,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序.将所测的序列与GenBank数据库中的GATA5基因序列进行比对以发现GATA5基因突变.应用多序列比对软件ClustalW评估突变氨基酸的保守性,应用致病性预测软件MutationTaster预测突变的致病性. 结果:在2例CHD患者各发现1个新的GATA5基因杂合错义突变,突变率为2%.其中1个是GATA5基因编码核苷酸序列第395位的鸟嘌呤(guanine,G)变为胸腺嘧啶(thymine,T),即c.395G>T突变;另一个是GATA5基因编码核苷酸序列第991位的胞嘧啶(cytosine,C)变为腺嘌呤(adenine,A),即c.991C>A突变.多序列比对显示2种突变氨基酸在进化上均高度保守.致病性预测显示2种突变均有致病性. 结论:本研究发现了CHD相关GATA5基因新突变,有助于揭示CHD新的分子机制.

作者:毛红柳;刘兴元

来源:国际心血管病杂志 2013 年 40卷 3期

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作者:
毛红柳;刘兴元
来源:
国际心血管病杂志 2013 年 40卷 3期
标签:
先天性心脏病 遗传学 转录因子 GATA5 突变
目的:识别先天性心脏病(CHD)相关GATA5基因新突变. 方法:收集100例无血缘关系的CHD患者和200名无血缘关系且种族匹配的健康对照者的临床资料和血标本.抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增GATA5基因的编码外显子及其剪接位点,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序.将所测的序列与GenBank数据库中的GATA5基因序列进行比对以发现GATA5基因突变.应用多序列比对软件ClustalW评估突变氨基酸的保守性,应用致病性预测软件MutationTaster预测突变的致病性. 结果:在2例CHD患者各发现1个新的GATA5基因杂合错义突变,突变率为2%.其中1个是GATA5基因编码核苷酸序列第395位的鸟嘌呤(guanine,G)变为胸腺嘧啶(thymine,T),即c.395G>T突变;另一个是GATA5基因编码核苷酸序列第991位的胞嘧啶(cytosine,C)变为腺嘌呤(adenine,A),即c.991C>A突变.多序列比对显示2种突变氨基酸在进化上均高度保守.致病性预测显示2种突变均有致病性. 结论:本研究发现了CHD相关GATA5基因新突变,有助于揭示CHD新的分子机制.