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目的:探索一种可以直接克隆差异表达基因全长cDNA的方法.方法:结合Clontech公司的"SMART PCR"cDNA合成技术和Promega公司的生物素-磁珠亲和技术,以鼻咽癌耐药细胞系CNE2/DDP及其亲代细胞CNE2为研究对象,采用一种基于PCR技术的改良消减杂交方法筛选并克隆耐药相关基因.点杂交鉴定排除假阳性,对部分差异表达片段测序并进行序列分析,RT-PCR对差异表达的基因片段做进一步验证.结果:用此方法建立了可以克隆差异表达基因cDNA全长的双向消减文库.经过对部分差异表达片段测序和序列分析,获得了6个耐药细胞差异表达的基因片断,其中5个有完整的开放读框,可能代表耐药相关的差异表达基因.对此5个序列登录GenBank并获得登录号为AY196929-196933.结论:改良的消减杂交方法是克隆差异表达基因的有效方法.应用此方法研究发现,有多个功能已知和未知的基因通过上调或降低其表达参与了鼻咽癌耐药性的产生.

作者:姜润德;张立新;岳文;李春海;王占民

来源:山东大学学报(医学版) 2005 年 43卷 4期

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作者:
姜润德;张立新;岳文;李春海;王占民
来源:
山东大学学报(医学版) 2005 年 43卷 4期
标签:
消减杂交 基因 多药耐药 鼻咽肿瘤
目的:探索一种可以直接克隆差异表达基因全长cDNA的方法.方法:结合Clontech公司的"SMART PCR"cDNA合成技术和Promega公司的生物素-磁珠亲和技术,以鼻咽癌耐药细胞系CNE2/DDP及其亲代细胞CNE2为研究对象,采用一种基于PCR技术的改良消减杂交方法筛选并克隆耐药相关基因.点杂交鉴定排除假阳性,对部分差异表达片段测序并进行序列分析,RT-PCR对差异表达的基因片段做进一步验证.结果:用此方法建立了可以克隆差异表达基因cDNA全长的双向消减文库.经过对部分差异表达片段测序和序列分析,获得了6个耐药细胞差异表达的基因片断,其中5个有完整的开放读框,可能代表耐药相关的差异表达基因.对此5个序列登录GenBank并获得登录号为AY196929-196933.结论:改良的消减杂交方法是克隆差异表达基因的有效方法.应用此方法研究发现,有多个功能已知和未知的基因通过上调或降低其表达参与了鼻咽癌耐药性的产生.