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目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨绞股蓝-虎杖治疗亚临床动脉粥样硬化(Sub-AS)的潜在分子机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台筛选绞股蓝、虎杖的活性成分及靶点,通过Genecards、OMIM数据库筛选Sub-AS相关靶点,通过Venny在线平台获取绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点,通过STRING 11.5构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行拓扑分析以筛选绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点;之后针对绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建药物活性成分-疾病靶点-通路网络;最后通过AutoDock vina V1.2.0和PyMol对筛选出的绞股蓝-虎杖核心活性成分与核心疾病靶点进行分子对接.结果 本研究共得到绞股蓝、虎杖活性成分24种,靶点208个;Sub-AS相关靶点1321个.最终得到97个绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点.构建PPI网络并进行拓扑分析,结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素(IL)6、IL4、IL10、IL1B、血管内皮生长因子(VEGF)A、基质金属蛋白酶(MMP)9、CXCL8、CCL2、细胞间黏附分子(ICAM)1、RELA是绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点.GO功能富集分析结果显示,细胞组成条目91个,主要包括膜筏、受体复合体、外侧细胞膜、细胞外基质等;分子功能条目128个,主要包括信号受体调节活动

作者:李佳;何俊;刘福明

来源:实用心脑肺血管病杂志 2023 年 31卷 1期

知识库介绍

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作者:
李佳;何俊;刘福明
来源:
实用心脑肺血管病杂志 2023 年 31卷 1期
标签:
动脉粥样硬化 亚临床动脉粥样硬化 绞股蓝 虎杖 网络药理学 分子对接技术
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨绞股蓝-虎杖治疗亚临床动脉粥样硬化(Sub-AS)的潜在分子机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台筛选绞股蓝、虎杖的活性成分及靶点,通过Genecards、OMIM数据库筛选Sub-AS相关靶点,通过Venny在线平台获取绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点,通过STRING 11.5构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行拓扑分析以筛选绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点;之后针对绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建药物活性成分-疾病靶点-通路网络;最后通过AutoDock vina V1.2.0和PyMol对筛选出的绞股蓝-虎杖核心活性成分与核心疾病靶点进行分子对接.结果 本研究共得到绞股蓝、虎杖活性成分24种,靶点208个;Sub-AS相关靶点1321个.最终得到97个绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点.构建PPI网络并进行拓扑分析,结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素(IL)6、IL4、IL10、IL1B、血管内皮生长因子(VEGF)A、基质金属蛋白酶(MMP)9、CXCL8、CCL2、细胞间黏附分子(ICAM)1、RELA是绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点.GO功能富集分析结果显示,细胞组成条目91个,主要包括膜筏、受体复合体、外侧细胞膜、细胞外基质等;分子功能条目128个,主要包括信号受体调节活动