目的 比较HAPGEN2、gs 2.0和GWAsimulator2三种方法在仿真单核苷酸多态性(SNPs)数据时的效能差异,为以后使用SNPs数据仿真方法提供指导. 方法 以真实人群SNPs数据作为原始数据,利用三种方法分别生成仿真数据,通过连锁不平衡模式和最小等位基因频率评价仿真效能,并通过x2差异位点评价致病位点的设置效能. 结果 HAP-GEN2仿真连锁不平衡模式的能力优于gs 2.0和GWAsimulator2,gs 2.0和GWAsimulator2仿真最小等位基因频率的能力近似且均优于HAPGEN2,三种方法均能良好的设置单致病位点. 结论 三种SNPs数据仿真方法均有优劣,用户可根据实际需求选择合适的仿真方法.
作者：刘芸良；肖纯；史晓雯；刘艳
来源：实用预防医学 2018 年 25卷 2期
