目的 基于高分辨率熔解(HRM)技术,建立敏感、经济、快速、适合临床应用的FTO基因rs9930506分型方法,并评价该基因变异与北京居民代谢综合征(MS)的关系.方法 参考GenBank的序列,设计rs9930506特异性的C3-spacer封闭的非标记探针,预混LC-Green plus染料,经PCR扩增和HRM反应,扫描荧光信号并分析基因型.设立酶切法和测序法为方法学对照,评价准确度和可操作性.在北京地区MS患者(500例)和对照组(500例)中应用该方法,探讨rs9930506变异与MS的关系.结果 3种方法均能较好实现rs9930506基因分型,HRM法最为简便快速,应答率为100%,以测序法为金标准,抽样准确度为99.3%.MS组中,AA、AG、GG基因型分别有290例、185例和25例,对照组中分别为344例、138例和18例.对照组与HapMap数据库中北京汉族人各基因型分布无统计学差异(P =0.520)并满足Hardy-Weinberg平衡.AA基因型可能降低MS的发生风险( OR=0.626,95% CI=0.483~0.812).结论 FTO基因s9930506 AA基因型的携带,可能是北京居民MS的保护因素;基于HRM技术建立的FTO基因rs9930506分型方法快速、准确、经济.
作者:孙亮;王晓霞;史晓红;孙雪峰;王丽萍;王天齐;唐雷;杨泽
来源:中华内科杂志 2012 年 51卷 1期