目的 基于GEO芯片联合网络药理学方法探讨黄芎方治疗缺血性脑卒中的作用机制,并构建脑缺血/再灌注(I/R)大鼠模型验证黄芎方药效和核心靶点.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库及文献检索,获得黄芎方的主要活性成分,通过Swiss Target Prediction数据库检索其相应的靶点.通过R软件limma包对GEO平台缺血性脑卒中患者数据集GSE16561进行差异基因分析.利用Venny 2.1.0进行黄芎方成分靶点和缺血性脑卒中差异基因靶点交集靶点分析,采用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.采用Cytoscape 3.9.0软件构建成分-靶点-通路网络并筛选核心成分,通过STRING数据库与Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点基因.利用PyMOL软件对度值排名靠前的成分和靶点基因进行分子对接.通过single sample Gene Set Enrichment Analysis(ssGSEA)进行免疫浸润分析.采用线栓法制备I/R大鼠模型,除假手术组外(n=21),将69只大鼠随机分为模型组、黄芎方组(3.6g·kg-1)组、阿司匹林(9mg·kg-1)组.黄芎方组和阿司匹林组每日ig给药1次,假手术组和模型组ig给予等量生理盐水,持续7d.采用Longa分级评分法对大鼠进行神经行为评分,TTC染色测定
作者:赵赛红;王磊;张平平;黄莹莹;汪宁
来源:药物评价研究 2023 年 46卷 5期