目的 通过生物信息学方法寻找肺动脉高压中差异表达的基因,为肺动脉高压的预防和早期诊断及治疗提供新思路.方法 从公共基因数据库(GEO)中下载基因芯片数据集GSE113439,使用在线分析工具GEO2R筛选出肺动脉高压肺组织和正常肺组织的差异表达基因.利用在线数据库DAVID和STRING分别进行功能、通路富集分析和蛋白互作分析,使用Cytoscape软件来筛选蛋白相互作用网络中的核心网络基因及显著相互作用模块.结果 共筛选出559个差异基因,其中87个为上调基因,472个为下调基因(调整后P<0.05,|log2FC|>1).对差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO富集分析(P<0.05)结果提示:(1)生物过程:差异表达基因显著富集于DNA双解、DNA修复、有丝分裂等;(2)细胞单位:差异表达基因显著富集于核质、膜、核仁、细胞质、中心体、核、核斑点、染色体、高尔基体等;(3)分子功能:差异表达基因显著富集于聚(A)RNA结合、ATP结合、蛋白质结合、解旋酶活性、微管结合、ATP依赖性DNA解旋酶活性等.KEGG富集分析结果提示差异表达基因显著富集于真核生物的核糖体生物发生、RNA转运、类风湿性关节炎、RNA降解、血管平滑肌收缩、疟疾、癌症中的蛋白多糖等(P<0.05).STRING分析发现了蛋白质网络互作图中的10个关键基因,分别为CDK1、CDC5L、KIF11、SMC2、CENP
作者：向杰；刘明鑫；张伟；黄从新
来源：心血管病学进展 2020 年 41卷 4期
