目的:通过整合分析基因的表达与拷贝数变异(CNV)识别癌症的驱动基因及调控子miRNAs.方法:通过整合基因表达与CNV数据,分别计算了乳腺癌、结肠癌、肺癌、肾癌、膀胱癌、头颈癌六种癌症中miRNAs的调控得分,提出了一个识别驱动基因和显著调控子miRNAs的方法.结果:本文研究发现,CNV区域上编码的基因相比于非CNV区域上编码的基因更倾向于受miRNAs调控.但是,癌相关CNV区域上的基因相比正常CNV区域上的基因更少受miRNAs调控.本研究识别出了EXOSC4、ZNF7、BOP1等原癌基因,以及miR-488、miR-27a、miR-454等在多种癌症中都起调控作用的调控子miRNAs.结论:本文的方法为癌症研究带来了新的启发,这些具有调控扩增基因过表达作用的miRNAs的发现,有助于我们更进一步了解癌基因表达的复杂调控机制,进而推动癌症的诊断、治疗和预后.
作者:许艳;张淑娟;常志强;张善镇;尚德思
来源:现代生物医学进展 2016 年 16卷 5期