目的:通过生物信息学技术探寻类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的发病机制,预测治疗RA的潜在中药.方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)提取数据集GSE1919、GSE55235、GSE55457基因片段原始数据,使用GEO2R在线分析工具筛选每个数据集的差异表达基因(diffferentialy expressed genes,DEGs),取交集得到RA的DEGs.利用DAVID数据库对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyo-to encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.利用STRING数据库构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction network,PPI)网络,使用Cytoscape3.7.0软件进行拓扑分析 筛选重点基因,采用GSE77298数据集进行验证筛选关键基因.将关键基因与在线中药预测工具Coremine Medical进行映射,筛选治疗RA的靶向中药.结果:基于GSE1919、GSE55235、GSE55457数据集筛选RA共同DEGs 33个.GO分析发现,分子功能主要涉及趋化因子活性、免疫球蛋白受体结合、抗原结合、肽聚糖结合等;细胞组分主要集中在质膜外侧、细胞外间隙、细胞外组分、质膜、IgM免疫球蛋白复合物等;生物过程主要集中在免疫应答、B细胞受体信号转导过程、适应性免疫反应、趋化因子介导的信

作者：姚承佼；李奕霖；熊钦；罗利红；谢凤娇；李廷林；谢文光；周京国；冯培民

来源：中医学报 2023 年 38卷 1期