应用生物信息学方法初步筛选缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的关键基因并探索发病机制,进而预测治疗IS的潜在中药.基于美国国家生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)下的基因芯片原始数据集GSE22255,纳入对象为20例缺血性脑卒中患者及20例性别和年龄匹配的对照者.基于R语言软件筛选差异表达基因(dif-ferentially expressed genes,DEGs),应用DAVID工具和R语言软件进行基因本体论(gene ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)通路分析,将DEGs导入STRING软件构建蛋白-蛋白互作网络,利用Cytoscape软件MCODE插件对关键功能模块进行可视化.通过将关键基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medi-cal)相互映射,筛选治疗IS的中药,并构建药物-活性成分-作用靶点网络.与对照组相比,IS患者中筛选出14个DEGs,其中12个基因上调,2个基因下调.DEGs主要参与免疫反应、炎症过程、信号转导、细胞增殖调控等生物过程.KEGG通路分析显示 DEGs 主要富集于白细胞介素 17(interleukin-17,IL-17)、核因子 κB(nuclear factor kappaB,NF-κB)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、核苷酸结合寡聚化结构域(nucleotide binding olig

作者：曹云；孔令博；黄幸；李晓琳；常静玲；高颖

来源：中国中药杂志 2021 年 46卷 7期