目的:基于网络药理学和分子对接研究人参-半夏-白术治疗癫痫病的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)查询人参、半夏、白术的有效成分和靶点.将TCMSP数据库获取的成分2D结构,导入PharmMapper数据库获得所有药物的成分靶点.通过PharmGKB、GeneCard、DrugBank、Therapeutic Target Database四个数据库预测疾病靶点.使用Venny 2.1韦恩图获得药物-疾病交集靶点.使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图.使用R语言和Cytoscape软件中的CytoNCA APP获取核心靶点.通过R语言结合R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析.使用Cytoscape软件建立"药物-成分-靶点-通路"的网络关系图.使用Autodock Vina 1.1.2将人参、半夏、白术的核心成分与核心靶点进行分子对接.结果:获得药物核心成分12个,主要为豆甾醇、β-谷甾醇、花生四烯酸酯等.核心靶点24个,主要为白细胞介素(Interleukin,IL)-1β、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1α、半胱氨酸蛋白酶3等.GO富集结果显示主要是对外来生物刺激、金属离子、细胞外刺激的反应等分子功能作用在突触后膜、突触膜和薄膜筏等细胞组分.KEGG富集包括30个信号通路(P<0.05),主要有丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-A
作者:史秀禄;孙阳龙;黄春元
来源:中医临床研究 2023 年 15卷 20期